Till Muskö tar du dig via en nästan 3 km lång biltunnel. Här finns Försvarsmaktens Haningegarnison, som sedan 1969 upptar en del av Muskö. Större delen av ön är öppen för friluftsliv, härliga strövområden och fina bär- och svampmarker.
När du kommer till Muskö, bör du besöka Muskö kyrka. Det är en träkyrka som invigdes redan under Gustav den II Adolfs tid, år 1630. Klockstapeln på berget bakom kyrkan är Muskös äldsta byggnadsverk. Den ena klockan är enligt inskrift skänkt av hovjunkaren baron Alexander Hummerhjelm.
På promenadavstånd från Muskö kyrka ligger det gamla torpet Grytholmen på vars område hembygdsföreningen har inrättat Grytholmens friluftsmuseum.
Nere vid Älvsnabben samlade kungen den flotta som förde över hären till Tyskland och den konflikt som senare skulle bli känd som Trettioåriga kriget. 1930 restes ett monument för detta på Kapellön ”till erinran om fädrens gärning”.
På Muskö finns även Arbottna - ett av de vackraste kulturlandskapen på Södertörn. Där ligger också en av Muskös två herrgårdar. Den andra herrgården är Ludvigsberg, som uppfördes 1776 av släkten Levin. Ludvigsberg drivs numera som hotell och konferensanläggning och här finns även Muskö turistbyrå. Uppe vid skolan ligger hembygdsgården. Den hyrs ut för möten, konferenser och fester.
På flera ställen finns fina bad, bland annat vid Björkholmen, Grytholmens friluftsområde nära skolan och vid Bruket på den allra sydligaste delen.